Table 2 Generated queries for each type of entity
Entity type | Query type | Generated query |
|---|---|---|
PROTEINAS | Guideline | “Las menciones de proteínas y genes incluyen péptidos, hormonas peptídicas y anticuerpos.” (Protein and gene mentions include peptides, peptide hormones, and antibodies.) |
Rule-template | ¿Qué entidades PROTEINAS se mencionan en el texto? (Which PROTEINAS entities are mentioned in the text?) | |
NORMALIZABLES | Guideline | “Menciones de productos químicos que pueden normalizarse manualmente a un identificador de concepto único.” (Chemical mentions that can be manually normalized to a unique concept identifier.) |
Rule-template | ¿Qué entidades NORMALIZABLES se mencionan en el texto? (Which NORMALIZABLE entities are mentioned in the text?) | |
NO_NORMALIZABLES | Guideline | “Menciones de productos químicos que no se pudieron normalizar manualmente a un identificador de concepto único.” (Chemical mentions that could not be manually normalized to a unique concept identifier.) |
Rule-template | ¿Qué entidades No_NORMALIZABLES se mencionan en el texto? (Which NON-NORMALIZABLE entities are mentioned in the text?) | |
UNCLEAR | Guideline | “Casos de menciones generales de clase de sustancias de relevancia clínica y biomédica, incluidas ciertas formulaciones farmacéuticas, tratamientos generales, programas de quimioterapia, vacunas y un conjunto predefinido de sustancias generales ( por ejemplo: Estragón, Silimarina, Bromelaína, Melanina, Vaselina, Lanolina, Alcohol, Tabaco, Marihuana, cannabis, opio y gluten).” (Cases of general mentions of class of substances of clinical and biomedical relevance, including certain pharmaceutical formulations, general treatments, chemotherapy programs, vaccines and a predefined set of general substances (for example: Tarragon, Silymarin, Bromelain, Melanin, Vaseline, Lanolin, Alcohol, Tobacco, Marijuana, cannabis, opium and gluten)) |
Rule-template | ¿Qué entidades UNCLEAR se mencionan en el texto? (Which UNCLEAR entities are mentioned in the text?) |