|  | Traditional CV |  | Drug-wise CV |  | Pairwise CV | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Reference Data | ML Method | AUPR | F1 | AUC | Â | AUPR | F1 | AUC | Â | AUPR | F1 | AUC |
DrugBank 4 | Logistic Regression | 0.75 | 0.70 | 0.76 | Â | 0.70 | 0.65 | 0.72 | Â | 0.66 | 0.60 | 0.67 |
 | Naive Bayes | 0.71 | 0.66 | 0.72 |  | 0.70 | 0.65 | 0.70 |  | 0.68 | 0.63 | 0.69 |
 | Random Forest | 0.90 | 0.84 | 0.91 |  | 0.78 | 0.69 | 0.79 |  | 0.69 | 0.52 | 0.70 |
KEGG | Logistic Regression | 0.77 | 0.71 | 0.78 | Â | 0.69 | 0.63 | 0.70 | Â | 0.62 | 0.54 | 0.62 |
 | Naive Bayes | 0.73 | 0.67 | 0.74 |  | 0.71 | 0.63 | 0.71 |  | 0.66 | 0.58 | 0.67 |
 | Random Forest | 0.85 | 0.79 | 0.86 |  | 0.78 | 0.68 | 0.79 |  | 0.67 | 0.38 | 0.67 |