Table 5 Error rates in real MAQC data using shadow linear regression and smoothing spline approaches
From: Empirical estimation of sequencing error rates using smoothing splines
Samples | SRER | EER_CS | EER_RS |
|---|---|---|---|
SRR037452 | 0.2695 | 0.3124 | 0.3362 |
SRR037453 | 0.1598 | 0.1819 | 0.1822 |
SRR037454 | 0.1596 | 0.2041 | 0.2196 |
SRR037455 | 0.1482 | 0.1694 | 0.1700 |
SRR037456 | 0.1657 | 0.2062 | 0.2162 |
SRR037457 | 0.1541 | 0.1796 | 0.1793 |
SRR037458 | 0.2386 | 0.2573 | 0.2575 |
SRR037459 | 0.1996 | 0.2216 | 0.2233 |
SRR037460 | 0.2027 | 0.2504 | 0.2647 |
SRR037461 | 0.1779 | 0.2058 | 0.2093 |
SRR037462 | 0.1858 | 0.2329 | 0.2319 |
SRR037463 | 0.1771 | 0.2019 | 0.2072 |
SRR037464 | 0.1850 | 0.2377 | 0.2448 |
SRR037465 | 0.1842 | 0.2019 | 0.2070 |