From: Empirical estimation of sequencing error rates using smoothing splines
Samples | Expected ER | SRER | SRER Bias | EER_CS | EER_CS Bias | EER_RS | EER_RS Bias |
---|---|---|---|---|---|---|---|
SRR032565 | 0.1991 | 0.0493 | 0.1498 | 0.1080 | 0.0911 | 0.1082 | 0.0910 |
SRR032566 | 0.0734 | 0.0412 | 0.0323 | 0.0705 | 0.0029 | 0.0705 | 0.0029 |
SRR032567 | 0.2003 | 0.0542 | 0.1461 | 0.1111 | 0.0892 | 0.1111 | 0.0893 |
SRR032568 | 0.2040 | 0.0437 | 0.1603 | 0.1057 | 0.0984 | 0.1072 | 0.0968 |
SRR032569 | 0.1598 | 0.0509 | 0.1089 | 0.1018 | 0.0580 | 0.1014 | 0.0585 |
SRR032570 | 0.0985 | 0.0641 | 0.0345 | 0.0959 | 0.0026 | 0.0954 | 0.0032 |
SRR032571 | 0.1236 | 0.0575 | 0.0661 | 0.1406 | 0.0170 | 0.1406 | 0.0170 |
SRR032572 | 0.1495 | 0.0530 | 0.0965 | 0.1181 | 0.0314 | 0.1173 | 0.0323 |
SRR032573 | 0.1779 | 0.0912 | 0.0867 | 0.1518 | 0.0261 | 0.1506 | 0.0273 |
SRR032574 | 0.0986 | 0.0384 | 0.0602 | 0.0626 | 0.0361 | 0.0618 | 0.0368 |
SRR032575 | 0.1169 | 0.0839 | 0.0330 | 0.1228 | 0.0059 | 0.1227 | 0.0058 |
SRR032576 | 0.1554 | 0.0945 | 0.0609 | 0.1887 | 0.0333 | 0.1880 | 0.0326 |
SRR032577 | 0.1052 | 0.0694 | 0.0359 | 0.1054 | 0.0002 | 0.1055 | 0.0002 |
SRR032578 | 0.1143 | 0.0448 | 0.0695 | 0.1077 | 0.0067 | 0.1076 | 0.0067 |
SRR032580 | 0.0870 | 0.0619 | 0.0251 | 0.1169 | 0.0298 | 0.1163 | 0.0292 |
SRR032581 | 0.0770 | 0.0347 | 0.0424 | 0.0752 | 0.0018 | 0.0751 | 0.0019 |
SRR032582 | 0.0400 | 0.0041 | 0.0359 | 0.0309 | 0.0091 | 0.0310 | 0.0090 |
SRR032583 | 0.1224 | 0.0707 | 0.0517 | 0.1279 | 0.0055 | 0.1280 | 0.0056 |
SRR032584 | 0.1290 | 0.0540 | 0.0750 | 0.1052 | 0.0238 | 0.1032 | 0.0259 |
SRR032586 | 0.0445 | 0.0102 | 0.0343 | 0.0287 | 0.0158 | 0.0287 | 0.0159 |
SRR032587 | 0.1486 | 0.0786 | 0.0700 | 0.1562 | 0.0076 | 0.1552 | 0.0066 |
SRR032588 | 0.1240 | 0.0470 | 0.0770 | 0.1024 | 0.0216 | 0.1021 | 0.0220 |
SRR033543 | 0.1151 | 0.0587 | 0.0564 | 0.0828 | 0.0323 | 0.0832 | 0.0318 |
SRR033544 | 0.1267 | 0.0524 | 0.0743 | 0.1086 | 0.0181 | 0.1085 | 0.0182 |