From: Empirical estimation of sequencing error rates using smoothing splines
Samples | Expected ER | SRER | SRER Bias | EER_CS | EER_CS Bias | EER_RS | EER_RS Bias |
---|---|---|---|---|---|---|---|
SRR037452 | 0.3305 | 0.2578 | 0.0727 | 0.3104 | 0.0201 | 0.3096 | 0.0209 |
SRR037453 | 0.1917 | 0.1584 | 0.0333 | 0.1824 | 0.0093 | 0.1818 | 0.0099 |
SRR037454 | 0.2354 | 0.1515 | 0.0839 | 0.2060 | 0.0294 | 0.2059 | 0.0295 |
SRR037455 | 0.1759 | 0.1448 | 0.0311 | 0.1675 | 0.0084 | 0.1668 | 0.0091 |
SRR037456 | 0.2312 | 0.1622 | 0.0690 | 0.2037 | 0.0275 | 0.2035 | 0.0277 |
SRR037457 | 0.1841 | 0.1480 | 0.0361 | 0.1777 | 0.0064 | 0.1771 | 0.0070 |
SRR037458 | 0.2653 | 0.2321 | 0.0332 | 0.2582 | 0.0071 | 0.2575 | 0.0078 |
SRR037459 | 0.2371 | 0.1943 | 0.0428 | 0.2202 | 0.0169 | 0.2203 | 0.0168 |
SRR037460 | 0.2530 | 0.2018 | 0.0512 | 0.2503 | 0.0027 | 0.2490 | 0.0040 |
SRR037461 | 0.2180 | 0.1704 | 0.0476 | 0.2105 | 0.0075 | 0.2104 | 0.0076 |
SRR037462 | 0.2443 | 0.1734 | 0.0709 | 0.2322 | 0.0121 | 0.2308 | 0.0135 |
SRR037463 | 0.2154 | 0.1654 | 0.0500 | 0.2023 | 0.0131 | 0.2045 | 0.0109 |
SRR037464 | 0.2624 | 0.1666 | 0.0958 | 0.2392 | 0.0232 | 0.2403 | 0.0221 |
SRR037465 | 0.2145 | 0.1742 | 0.0403 | 0.2038 | 0.0107 | 0.2037 | 0.0108 |