Skip to main content

Table 1 Content of the three NUCOCOG databases

From: Extension of the COG and arCOG databases by amino acid and nucleotide sequences

 

NUCOCOG

arNUCOCOG

NUCOCOG_2

domain sequences

144,320

81,616

204,890

Nucleotides

142,675,176

72,324,636

195,633,198

stop codons

94

62

115

a. a. a.: B

41

-

41

a. a. a.: U

24

27

42

a. a. a.: X

1,243

89

1,288

a. a. a.: Z

12

-

12

a. n.: b

9

-

9

a. n.: d

9

-

9

a. n.: h

4

-

4

a. n.: k

189

-

189

a. n.: m

163

3

164

a. n.: n

195

110

301

a. n.: r

328

1

328

a. n.: s

258

-

258

a. n.: v

7

-

7

a. n.: w

113

-

113

a. n.: y

660

3

660

  1. The abbreviations used are a. a. a. for ambiguous amino acids and a. n. for ambiguous nucleotides.