Skip to main content

Table 2 Herpesviruses : HSS at 5% level using the conservative bound.

From: AT excursion: a new approach to predict replication origins in viral genomes by locating AT-rich regions

HSS HSS
Virus Start Peak Value Virus Start Peak Value
alhv1 1204 1370 54 ebv 11854 11950 45
  32478 32850 48   77111 77150 24
  113630 113684 46   43158 43235 23
  85923 85992 45 ehv1 20348 20431 47
  72999 73115 44   134195 134276 36
  125691 125726 31   65055 65126 35
athv3 8827 8892 40   99301 99374 34
bohv1 100410 100484 26   11034 11141 32
  109702 109730 25   105796 105862 30
  128487 128515 25   73653 73746 27
  16593 16626 21   113818 113849 25
  113720 113738 18   149310 149341 25
  124479 124497 18   110314 110352 23
  29 45 16   128924 128992 23
  58542 58569 15 ehv2 160281 160518 102
bohv4 60687 60826 35   86522 86622 76
bohv5 68440 68507 49   53843 54012 61
  113549 113583 28   140661 140826 57
  129429 129463 28   4580 4655 51
  592 616 21   171454 171529 51
  86191 86215 21   95342 95440 50
  102074 102106 17   10772 10820 48
  92511 92535 15   39893 39977 48
  120935 120959 15   177646 177694 48
  59921 59938 14   113310 113399 47
  17408 17433 13   134709 134772 45
  41883 41899 13   166114 166207 42
calhv3 70131 70198 31   45831 45965 41
ccmv 50872 50973 50   15443 15482 39
  158344 158701 45   19722 19845 39
  95375 95603 39   182317 182356 39
  3519 3602 35   153977 154145 36
  24084 24156 33   123321 123362 35
  182982 183136 31   147222 147341 35
  14314 14370 23   34816 34884 29
  177170 177247 23   76380 76454 29
  189041 189075 22   103167 103223 29
  147310 147384 20   64344 64402 25
cehv1 116723 116836 53   786 831 24
  92092 92118 26 ehv4 109852 110086 60
  61680 61700 20   19878 19943 50
  132785 132805 20   132383 132462 49
  149415 149435 20   105284 105365 48
  52055 52075 17   23895 24016 43
  42984 43006 16   3984 4110 42
  11389 11407 15   73340 73509 37
  24415 24441 14   98849 98930 33
cehv15 11965 12011 28   46612 46674 32
  114927 114988 19   10630 10697 31
cehv16 92913 92940 23   58833 58906 31
  62970 62991 21   82616 82701 31
  133468 133489 21   127230 127351 31
  149813 149834 21   112929 112967 29
  8303 8331 20   145082 145120 29
  118685 118713 20 gahv1 24852 24890 30
  53056 53100 18 gahv2 106724 106811 35
  25423 25473 16 gahv3 11168 11198 27
  1717 1736 15   122384 122414 27
  114861 114890 15   134414 134461 26
  125280 125299 15   162999 163046 26
  30975 30991 14   58953 58999 25
cehv2 7681 7738 33 hcmv 3402 3542 41
  115791 115848 33   186855 186995 41
  61483 61503 20   16757 16915 35
  129527 129547 20   96685 96824 34
  144461 144481 20   11713 11808 32
  90857 90884 19   198116 198171 31
  51884 51910 14   173560 173599 30
  93873 93887 14   210724 210781 30
  112292 112320 14   26361 26475 27
cehv7 86167 86296 37   108222 108303 24
cehv8 149643 149720 33   159296 159380 24
  15671 15733 30   71011 71055 23
  29233 29278 29   226192 226230 23
  163766 163806 28     
  177904 178092 28     
  89538 89589 27     
hcmv-m 3798 3939 42 mfrv 128046 128640 114
  181238 181334 33   23139 23374 109
  97069 97206 32   2488 3068 106
  173950 173994 32   32573 33752 84
  216020 216077 30   64296 64454 62
  203400 203456 29   111496 111624 44
  17082 17297 26   72739 72809 43
  12060 12145 25   53766 53825 32
  157590 157726 25   69912 70061 32
hhv6 130410 130501 59   114828 114860 32
  3605 3712 51 mmrv 2388 2967 111
  154838 154945 51   23902 24187 108
  137079 137210 43   33761 35136 103
hhv6b 132997 133163 62   130346 131085 97
  139482 139569 51   65611 65853 56
  3911 3988 37   74140 74204 37
  157232 157309 37   71311 71462 31
hhv7 134169 134376 117   117507 117551 29
  128589 128984 70   112930 113033 28
hhv8 136287 136704 93 muhv4 6000 6037 29
  982 1125 44 ohv2 115365 115545 72
  58833 58906 28   126823 127116 68
  23547 23598 27   118943 118988 42
  30712 30775 27   72630 72699 36
  119416 119467 27   1269 1370 29
  106412 106452 25   27589 27633 29
hsv1 62465 62485 20   76335 76370 26
  35000 35034 19   79158 79265 26
  115242 115303 19 oshv1 73292 73460 64
  131990 132008 18   35416 35493 61
  144115 144142 18   146021 146164 55
  11705 11734 17   190174 190312 54
  52753 52818 17   195928 196026 54
  96047 96069 16   201648 201786 54
  136146 136162 16   23065 23135 50
hsv2 5584 5628 35   161395 161505 50
  121621 121665 35   2682 2735 49
  52978 53003 19   180276 180329 49
  91716 91747 19   108068 108173 45
  146600 146631 19   171433 171549 44
  95238 95256 18   67872 67975 43
  48761 48778 17   114689 114763 42
  62919 62939 17 pshv1 18751 18791 31
  132691 132711 17   121452 121486 31
  81195 81220 16   160685 160719 31
  99337 99370 15   130332 130365 27
ichv1 6068 6290 81   151806 151839 27
  121738 121960 81   23896 23942 22
  104134 104399 70   134013 134049 21
  17065 17333 58   78233 78256 20
  132735 133003 58 rcmv 150923 151612 92
  451 726 50   207600 207980 80
  116121 116396 50   143617 144150 74
  60752 60845 30   178241 178326 37
  42919 43007 28   214638 214702 37
  20109 20187 24   219069 219153 33
  10016 10063 23   201767 201885 28
  125686 125733 23   161797 161929 27
mcmv 155163 156341 125   171828 171870 27
      24072 24108 21
  161228 161391 40 sahv2 28533 28613 45
  115543 115640 37 shv1 63862 63892 24
  102865 102960 35   96251 96275 21
  79497 79573 34   114686 114715 20
  15628 15724 33   129607 129636 20
  144170 144290 33   50382 50407 19
  73525 73579 27   75955 75984 17
  39209 39248 24   16151 16172 15
  92997 93036 24   33045 33063 15
  219239 219282 22   109083 109098 15
mehv1   NIL    135503 135518 15
      8432 8455 14
     thv 168842 168927 25
      24153 24200 23
      28257 28286 17
     vzv 2574 2785 39
      110195 110227 32
      119669 119701 32
  1. Entries in italics are significant at 1% too.